Uno dei principali promotori del CINECA è stato il Ministero della Pubblica Istruzione, le cui competenze sono ora passate al Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca (MIUR).

Il CINECA realizza e gestisce i più importanti servizi on line a supporto del sistema universitario nazionale, attraverso banche dati e sistemi informatici telematici che utilizzano come infrastruttura di comunicazione la rete GARR. In tal modo il MIUR coordina e monitora al suo interno l'interazione tra gli uffici, gli organi di consulenza, le università e i ricercatori.